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Schneller und günstiger als ein gewöhnliches Blutbild: Forschende der Charité - Universitätsmedizin Berlin und des Francis Crick Institute um Einstein-Professor Markus Ralser haben die Technologie der Massenspektrometrie so weiterentwickelt, dass sich Tausende von Proteinen in einer Probe innerhalb weniger Minuten vermessen lassen. Das Potenzial der Technik demonstriert das Forschungsteam anhand der Analyse des Blutplasmas von COVID-19-Betroffenen: Mit der neuen Technologie identifizierte es elf bisher unbekannte Proteine, die den Schweregrad der Erkrankung anzeigen. Die Studie ist im Fachmagazin Nature Biotechnology* veröffentlicht. Zu jedem Zeitpunkt sind im menschlichen Körper Tausende verschiedener Proteine aktiv: Sie geben ihm seine Struktur und ermöglichen lebenswichtige Reaktionen. Auch wenn der Körper auf äußere Einwirkungen wie Erreger oder Medikamente reagiert, steigert oder senkt er die Aktivität unterschiedlicher Proteine. Das detaillierte Muster von Proteinen in…

Forschende der Charité – Universitätsmedizin Berlin um den ehemaligen Einstein Junior Fellow Frederick Klauschen haben ein neues Analyse-System für die Brustkrebsdiagnostik anhand von Gewebeschnitten entwickelt, das Künstliche Intelligenz (KI) nutzt. Zwei Weiterentwicklungen machen das System einzigartig: Es integriert erstmals morphologische, molekulare und histologische Daten in einer Auswertung und macht mit Heatmap den Entscheidungsprozess der KI nachvollziehbar. Ärzt*innen können das Ergebnis so auf Plausibilität prüfen. Dies ist ein wichtiger Schritt, um künftig auf maschinellem Lernen basierte Systeme im Klinik-Alltag unterstützend zur medizinischen Diagnose einzusetzen. Krebsmedizin beschäftigt sich zunehmend mit der molekularen Charakterisierung von Tumorgewebeproben. Ermittelt wird dabei unter anderem der Methylierungszustand der DNA, die Genexpression, somatische Mutationen oder auch die Protein-Expression in den pathologischen Präparaten. Gleichzeitig setzt sich die…

Einstein-Professor Michael Joswig von der Technischen Universität Berlin wurde für die gemeinsam mit Xavier Allamigeon, Pascal Benchimol und Stéphane Gaubert von der École Polytechnique bei Paris verfasste Arbeit "Log-barrier interior point methods are not strongly polynomial” von der Society of Industrial and Applied Mathematics (SIAM) mit dem renommierten SIGEST-Preis ausgezeichnet. Die Arbeit befasst sich mit einem speziellen Problem zum Lösen linearer Programme. Die von Michael Joswig gemeinsam mit seinen Kollegen verfasste Arbeit leistet einen maßgeblichen Beitrag für das Verständnis des neunten Problems auf der sogenannten Smale-Liste. Der Fields-Medaillist Steven Smale hatte im Jahr 2000 eine Liste von 18 mathematischen Problemen zusammengestellt, die er für wegweisend für die Entwicklung der Mathematik des 21. Jahrhunderts hielt. Beim Problem Nummer 9 geht es um die Frage, wie schnell sich lineare Programme genau lösen lassen. Der ausgezeichnete Artikel erschien nun in…

Eine Forschungsgruppe um den Physiker Holger Dau und Einstein Visiting Fellow Robert Burnap an der Freien Universität hat nachgewiesen, dass Proteinkomplexe der heutigen Photosynthese unter Belichtung Manganoxid (Braunstein) bilden können. Das interdisziplinäre Team untermauerte damit die Hypothese einer Manganoxid-bildenden Photosynthese in der frühen Erdgeschichte. Das interdisziplinäre Forschungsteam isolierte das sogenannte Photosystem II (PSII) aus Spinatblättern und entfernte die vier Mangan-Atome, die in der heutigen Photosynthese Wasser spalten und den atmosphärischen Sauerstoff bilden. Mit diesen Mangan-freien Photosystemen wurde rekonstruiert, was sich vor Jahrmilliarden in einer frühen Form der Photosynthese abgespielt haben könnte. Die Studie erschien im renommierten Wissenschaftszeitschrift „Nature Communications“.

Ein internationales Forschungsteam um Andreas Meisel von der Charité – Universitätsmedizin hat im Rahmen eines Einstein-Forschungsvorhabens die zentrale Rolle kleiner regulatorischer RNA-Moleküle bei einer Immunreaktion nach einem Schlaganfall erhellen können. Die Erkenntnisse der unter anderem in Kooperation mit Hermona Soreq von der Hebrew University Jerusalem entstandenen Studie wurden in der Fachzeitschrift Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America veröffentlicht. Ein internationales Forscherteam unter Beteiligung der Charité - Universitätsmedizin Berlin hat nun erstmalig die komplexe Rolle von verschiedenen Untergruppen kleiner RNA-Moleküle (small RNA) in Monozyten, einer Untergruppe weißer Blutzellen, untersucht. Die Funktion der Monozyten, die eine wichtige Rolle in der antibakteriellen Abwehr des Körpers spielen, sind nach einem Schlaganfall gestört. Eine Arbeitsgruppe von Andreas Meisel an der Charité untersucht schon seit vielen…